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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

厚衣服备起！今夜起重庆各地将逐渐迎来雨雪天气******url:https://m.gmw.cn/2023-01/11/content_1303251838.htm,id:1303251838

　　阳光躲猫猫，江边雾蒙蒙。华龙网-新重庆客户端记者 李裕锟 摄

　　今（11）日，重庆大部持续好天气。15时，各地气温普遍在10-15℃之间，石柱最暖和，为18.1℃，云阳17℃，沙坪坝13.8℃。

　　不过，这样的好天气即将结束。今日10时，中央气象台继续发布寒潮蓝色预警，预计11日至15日，寒潮天气将自西向东影响我国大部地区，气温将先后下降8～12℃。降温过后，17日早晨，最低气温0℃线将南压至云南东部至贵州南部、湖南南部、福建北部、浙江东部一线。

　　中国天气网气象分析师石妍介绍，本轮冷空气强度较强，移速较慢，在其东移南下的过程中，还将与加强的暖湿气流相结合，导致我国中东部地区雨雪待机时间较长，影响范围覆盖超27省份，12日至15日将是雨雪的核心影响时段。

　　受这股冷空气影响，重庆也将经历一次明显的降温降雨（雪）天气过程。重庆市气象台预计，今天夜间东北部高海拔地区有飘雪；后天中东部地区有雨水来袭，海拔1000米以上地区有雨夹雪或小雪。

　　专家提醒，临近春节假期，自驾返乡的市民需注意关注道路及天气实况，谨防路段结冰、起雾等情况。自驾如果遇见道路结冰或起雾，在行车时应要做到“四缓”，起步缓、转弯缓、制动缓、心态缓，最大限度保证行车安全。

　　今明两天受雾影响的主要路段有：G50沪渝高速渝北段，G65包茂高速巴南、南川、武隆段，G75包茂高速綦江段，G85银昆高速永川、荣昌段，G93成渝环线铜梁至潼南段。重庆范围内铁路线路受天气影响不大。

　　全国大风降温预报图。中央气象台官网截图

　　未来天气情况

　　11日夜间到12日白天，重庆东部部分地区阴天有间断小雨，其余地区阴天间多云，气温3～17℃。中心城区阴天间多云，气温10～15℃。

　　12日夜间到13日白天，重庆中东部地区阴天有间断小雨，海拔1000 米以上地区有雨夹雪或小雪，其余地区阴天，气温2～15℃。中心城区阴天，气温9～14℃。

　　13日夜间到14日白天，重庆大部地区阴天有间断小雨，海拔800米以上地区有小到中雪，山口河谷地区有4-6级阵风，气温-4～11℃。中心城区阴天有间断小雨，气温5～11℃。

　　华龙网-新重庆客户端（梁浩楠）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）